Située dans une région très touristique, de transport maritime, de pêche et d'activités quotidiennes des habitants vivant et exerçant leurs activités commerciales dans la baie d'Ha Long, la gestion de la zone, mise en place depuis l'inscription du site, applique des réglementations strictes et contrôle des activités afin de réduire au maximum les impacts sur l'intégrité du site. Il existe un défi constant pour améliorer l'intégrité et la qualité de l'environnement. Les caractéristiques naturelles pittoresques, la géomorphologie, les valeurs des formes de relief et le patrimoine culturel, ainsi que des éléments clés tels que les îles, les grottes et les cavernes, demeurent intacts et le site conserve un haut niveau de naturalité malgré la longue histoire de l'occupation humaine dans la région.